После революции в России 1917 года, начала эпохи Таджикистан в Советском Союзе, было отменено Туркестанское генерал губернаторство. 30 апреля 1918 года на V съезде Советов области было провозглашено об образовании АССР Туркестан в составе РСФСР. Были национализированы земельные и водные ресурсы, банковская система, железные дороги и промышленность. В октябре очередной съезд Советов принял Конституцию Туркестанской АССР.
В 1918 году Северный Таджикистан вошел в состав провозглашенной АССР Туркестан, южный – в Бухарский эмират. Советский Союз встретил сопротивление контрреволюционных сил мегаполисов региона и местных националистов, получивших поддержку из-за рубежа – от Великобритании. В начале декабря 1917 г. Четвертый чрезвычайный областной мусульманский конгресс в Коканде провозгласил Туркестан автономией и провозгласил автономию Коканда, однако эта инициатива не была реализована. Было основано антибольшевистское подполье. Басмачи (сепаратистское военно-политическое и религиозно-партизанское движение) развилось в узбекских областях Туркестана с центром в Ферганской долине. Бухарское и Хивинское ханства поддержали борьбу против АССР Туркестана.
Организованное широкомасштабное сопротивление советской власти в Туркестане было подавлено в 1920 году. В 1920 году он был взят частями Красной Армии и частями Старой Бухары, затем была создана Советская Народная Республика Бухара. В 1921 году войсками Эмира Бухары были освобождены части Гиссарского экспедиционного командования Душанбе. В 1924 году ЦК Коммунистической партии принял постановление о национальном разделении среднеазиатских республик, что привело к образованию в Узбекской ССР ряда республик, в том числе и АССР Таджикистана. Население Таджикистана в то время составляло 740 000 человек при 5-миллионном населении Узбекской ССР. Столицей республики был город Душанбе, который в 1920 году представлял собой поселение с населением 3000 человек.
В 1929 году в Советском Союзе АССР Таджикистан был преобразован в Таджикскую ССР. Началось формирование национальных и государственных институтов. Первая советская газета была издана в Таджикистане в 1926 году. Стали формироваться школы и другие образовательные учреждения.
Во время проведения новой экономической политики правительство Советского Союза пыталось значительно увеличить выращивание хлопка в Таджикистане. Однако к концу новой экономической политики дореволюционное производство хлопка еще не было достигнуто.
Коллективизация в Таджикистане была относительно умеренной в 1927-1929 гг. и радикальной в 1930-1934 гг. Основной целью было значительное увеличение объемов выращивания хлопка в Таджикистане, особенно в южных регионах страны. Фермеры всячески выступали против коллективизации, что привело к возрождению басмачского движения в начале 1930-х годов. В межвоенный период также наблюдался низкий уровень промышленного роста.
Во время политических чисток партии в 1930-х годах около 70 процентов членов Коммунистической партии Таджикистана были исключены и подавлены на всех уровнях. С 1932 по 1937 год число таджиков в коммунистической партии сократилось с 53% до 45%. Многие из них были заменены русскими, отправленными из Москвы. Позднее Центр стремился достичь определенного баланса между таджиками и русскими в высших эшелонах власти для обеспечения стабильности и лояльности в регионе.
С 1937 года и до распада Советского Союза политическая элита страны вербовалась в основном из Ленинабада, региона, который больше всего выиграл от индустриализации и урбанизации. Поскольку в Таджикистане были и остаются очень сильные региональные противоречия, Москва была вынуждена опираться в своей кадровой политике на один из регионов и не пытаться глубоко вникать в тонкости таджикских межрегиональных отношений. В результате таджикская политическая элита была набрана в основном из северной, наиболее промышленно развитой Ленинабадской области (в которой также проживает наибольшая часть русскоязычного населения) и из Кулябского района. В период с 1946 по 1991 год все первые секретари ЦК Компартии Таджикистана были из Ленинабада. С 1970 года Куляб выступал в качестве “младшего партнера” Ленинабада и в основном отвечал за военные дела. Горно-Бадахшанская автономная область также входила в эту систему и предоставляла чиновников среднего звена для Комитета национальной безопасности страны.
В 1951 году Турсунбай Улджабайев сменил Гафурова в должности Первого секретаря ЦК Компартии Таджикистана. В 1956 году Улджабайев был со скандалом отправлен в отставку по обвинениям в завышении показателей выращивания хлопка в республике.
Его сменил Джаббор Расулов, остававшийся в должности вплоть до смерти Брежнева в 1982 году.
Его преемником стал Рахмон Набиев (1982–1985 годы), который был отправлен в отставку Михаилом Горбачевым, стремившимся избавиться от брежневских советских кадров. Набиев вновь был назначен Первым секретарём в 1991 году.
При этом вторым секретарём в ЦК КПТ всегда был русский, присланный из Москвы, контролировавший деятельность высшего таджикского партийного и советского руководства. В Таджикистане с его слабой национальной идентификацией Центр играл роль балансира, обеспечивая сохранение хрупкого политического баланса между регионами. После распада Советского Союза именно этнорегиональные противоречия стали причиной кровопролитной гражданской войны, когда представители регионов стремились к переделу власти. Гражданская война в 1990-е годы, по разным оценкам, привела к 60–100 тысячам жертв, около 1 миллиона человек стали беженцами.